Quienes han tenido el honor y la gran responsabilidad de dirigir en diferentes periodos de gestión al valioso equipo de la ENFT
Fundador
Lic. Jesús Ortiz Figueroa
El fundador y primer director durante el periodo de 1994 a 1998, que anteriormente fue Subsecretario de Educación y primer Director General del Instituto de Servicios Educativos y Pedagógicos de Baja California (ISEP)
Ex Director
Lic. Juan Carlos Madrueño Pinto
Durante el periodo de 2006 a 2010, y anteriormente Jefe del Departamento de Educación Especial en Baja California.
Ex Director
Lic. Rafael Núñez Jiménez
de 1998 a 1999, que anteriormente fue Director de Educación de la Secretaría de Educación y Bienestar Social (SEBS) de Baja California.
Ex Director
Lic. Martín Gutiérrez Gaeta
En el periodo 2010-2015
Ex Directora
Lic. Sofía Cuevas Silva
Durante el periodo de 1999 a 2006, quien anteriormente fue Directora de Educación Media en la entidad;
Ex Directora
Lic. Gabriela Núñez de León
Durante el periodo 2015 a 2021
Directora
Catalina Guadalupe Ortiz Macías
a partir de 2021
Habrán de venir, en el futuro próximo, otras directoras o directores que tendrán la responsabilidad y compromiso de coordinar los esfuerzos de esta institución hacia el bien común.